深势科技范梦奇：“难成药”靶点存在巨大机会

北京日报客户端 | 记者 孙奇茹

12月17日，在2022北京亦庄创新发布·生物医药高质量发展论坛上，深势科技生物医药事业群副总裁范梦奇发表了题为“基于AI for Science新范式 Hermite新一代药物计算设计平台——驱动难成药靶点的理性设计”的主题演讲。范梦奇认为，在AI for Science（AI用于科学发现）新范式下，过去难以使用传统方法进行理性药物设计的“难成药”靶点存在巨大的潜在机会。

深势科技致力于运用人工智能和分子模拟算法,结合先进计算手段求解重要科学问题，为人类文明最基础的生物医药、能源、材料和信息科学与工程研究打造新一代微尺度工业设计和仿真平台。

范梦奇称，在生物和药物研发领域，当下面临着复杂系统的物理模型难以求解、数据的信噪比过低、数据稀疏难以拟合等难题，而AI for Science为解决这些问题带来新的可能，驱动着微尺度下的工业设计革命。

具体而言，物理驱动的AI for Science突破传统分子模拟计算局限，而数据驱动的AI for Science则能突破蛋白结构和分子性质预测瓶颈。深势科技的分子模拟方法就将人工智能算法和物理模型相结合，实现了对分子结构层面的大规模、高效仿真和模拟。其原理是依靠确定的物理规律对微观世界的分子和原子如何运动进行计算，AI在其中起到的作用是为物理模型计算、数据挖掘和数据处理加速，通俗地来说，就是“教会AI解物理方程式”。

有了“AI for Science”这样的新范式后，势必还要去研发出真正的工业化的平台和工具，提供给药物设计工作者。今年10月，深势科技的新一代药物计算设计平台Hermite正式发布。Hermite平台融合了蛋白结构预测Uni-Fold、自由能微扰计算Uni-FEP等核心算法，帮助药物设计人员完成从靶点结构解析、预测与精修，到苗头化合物筛选，再到先导化合物优化和性质预测的一体化工作。

在Hermite平台的支撑下，昔日的药物研发“难解之题”也正在逐渐破题。范梦奇在演讲中提出，“难成药”靶点存在巨大的潜在机会，这些机会可能存在于：无结构靶标、隐藏别构位点、固有无序蛋白等方向。

何谓“难成药”靶点？据悉，理性药物设计需要靶标蛋白具有明确的结构和清晰的作用位点，这类靶点通常称为“可成药”靶点，在人类靶点中占15%左右。其余85%为“难成药”靶点，一般体现在蛋白表面平坦无清晰作用位点，或者蛋白结构柔性大，甚至没有稳定的三维结构。

“目前，在医药研发方面，低垂果实已经不再唾手可及，我们面临一个新的时代。”范梦奇称，深势科技的药物研发团队将研发重点放在了难成药靶点上，目前已经收获了基于RiDymo强化动力学平台发现全新可药口袋等阶段性进展。

图片来源：受访者供图