事关白血病，上海儿童医学中心团队发布最新研究成果

近日，国家儿童医学中心（上海）、上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心刘宇和沈树红研究团队在 《Nature Communications》 发表了题为“复发急性B淋巴细胞白血病染色质可及性图谱”的研究论文，从染色质可及性的角度对复发B-ALL基因组特征进行分析，详细描绘了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病的染色质可及性图谱，发现了药物治疗相关的染色质可及性改变，并进一步确定了一组早期复发的B-ALL亚群，提示了染色质可及性改变在儿童B-ALL的发生、药物反应和耐药复发中的重要作用。

儿童B细胞急性淋巴细胞白血病是最常见的儿童恶性肿瘤。分析发现，B-ALL基因组中染色质开放区域（ACR）首先集中在活跃转录调控相关的基因组区域，与其功能相一致。值得注意的是，在没有任何目前已知组蛋白修饰的Quies区域也检测到较高的ACR占比。这一现象部分来自于B-ALL中活性转录调控元件的异质性，另一方面也提示存在尚不清楚的表观基因组学修饰参与肿瘤的发生。随后研究团队通过与B系祖细胞进行对比，分析得到了一组B-ALL特异性ACR，其具有更强的异质性，调控的靶基因显著富集在肿瘤相关生物学过程中，其中包括在IL7R、MYC等白血病的发生中起到重要作用的基因。该结果提示了染色质开放性改变在白血病发生中的重要作用。

研究团队还对比分析了复发相关的染色质开放区域改变，并通过QTL将这些复发相关ACR与潜在调控基因相关联。结合CTD^2中的药物敏感性数据，发现复发相关ACR与白血病细胞药物治疗相关，提示药物治疗可能在B-ALL复发过程中重塑了肿瘤细胞的染色质可及性，进而影响了相关基因的转录调控。通过进一步鉴定，发现70,573个ACR与患者的无复发生存率（RFS）显著相关，根据这组RFS-ACR的开放程度可以将病人分为早期复发和晚期复发两组，并进一步使用TARGET研究队列中252例B-ALL对该结果进行了验证。值得注意的是，团队不仅从既往认为预后较好的Hyperdiploidy亚型病人鉴别出了一组早期复发的患者，同时该现象在TARGET队列的Hyperdiploidy亚型病人中也得到了验证，提示从染色质可及性角度出发可以为B-ALL风险度分层提供新的信息，进一步细分不同风险度分层的患儿亚群，以便临床进行早期干预。