4万年前北京田园洞男子全基因组数据揭示了他不是我们的直接祖先

根据《当代生物学》杂志的一项新研究，对4万年前死于中国北京附近的田园洞的一名男子的基因组进行分析，东亚人类的生物DNA构成正在形成一个非常复杂的故事，其多样性和远距离接触比以前所知的更多。

中国科学院古脊椎动物与古人类研究所分子古生物学实验室的付巧妹教授领导的团队，可以使用先进的古代DNA测序技术，从田园人的骨骼中提取跨越人类基因组的DNA。

尽管在欧洲和西伯利亚已经对一些古代人类进行了测序，但在东亚，特别是中国，很少有人进行了测序。中国的考古记录显示了早期现代人类的丰富历史。这项关于田园人的新研究标志着东亚最早的古代DNA，以及中国第一个全基因组的古代人类数据。

2013年，同一实验室对田园人进行了研究。然后，他们发现，田园人与当今亚洲人的关系比与当今欧洲人的关系更密切，这表明该地区当今的亚洲人类历史可以追溯到40000年前。随着新的分子技术在过去两年才发表，傅教授和她的团队与马克斯·普朗克进化人类学研究所和加州大学伯克利分校的专家联合合作，对基因组的更多区域进行了测序和分析，特别是在其他古人类中也进行了测序的相应位置。

付巧妹教授

自2013年以来，从古代欧洲人身上采集的DNA表明，所有现代欧洲人中的大部分人群都源于史前人群，这些人群在移民出非洲后不久就与其他早期非非洲人群分离。现代欧洲人的混合血统可能会使基因相似性测试产生偏差，包括田园人的也会有相似结果。

然而，根据最新公布的数据，付巧梅教授实验室表明，田园人与现代亚洲人的基因相似性仍然存在，也包括没有混血的古欧洲人。实验证实，40000年前的田园人与当今亚洲人的关系最为密切。

然而，这并不是他们发现的最令人兴奋的结果。

由于与当今亚洲人有着密切的关系，他们希望田园人和古代欧洲人比较时，能像和当今亚洲人一样有着相似处。令人惊讶的是，他们发现一个来自比利时的3.5万岁个体GoyetQ116-1在其他方面表现得像古代欧洲人，而且与田园人个体有着其他古代欧洲人所没有的基因相似性。这不太可能是由于欧亚大陆东西海岸附近人口之间的直接互动，因为其他古代欧洲人没有表现出类似的结果。相反，研究人员认为，以田园和戈耶Q116-1为代表的两个种群在欧亚分离之前，其部分祖先来自同一亚种群。观察到的这两个古代个体之间的遗传关系直接证明了欧洲和亚洲种群有着复杂的历史。

第二个意想不到的结果揭示了史前东亚地区人类基因的多样性。

2015年，一项比较亚洲、太平洋和美洲当代人口的研究表明，一些来自南美洲的美洲原住民与亚洲大陆以南的一些人口有着不同寻常的联系，最著名的是美拉尼西亚巴布亚人和安达曼群岛翁格人。该研究表明，大约2万年前进入美洲的人口不能被视为一个单一的单位。相反，大约在同一时间段，一个或多个相关但不同的种群交叉，其中至少有一个种群与亚洲种群有额外的联系，而亚洲种群也促成了今天的巴布亚岛和昂热岛。

在今天的东亚人和西伯利亚人身上没有观察到这种联系的痕迹，但与他们不同的是，北京田园人也与同样的南美洲人有基因相似之处，其模式与巴布亚人和翁格人相似。这项新研究直接证实，美洲原住民的多个祖先都来自亚洲大陆。然而，有趣的是，迁徙到美洲大约发生在20000年前，但田园个体的年龄是这个年龄的两倍。因此，自40000年前以来，美洲的人口多样性一直存在，亚洲大陆的两个或两个以上不同人群在美洲传播了他们的基因血统。

田园人只是一个个体，但傅教授和她的团队对他的基因组进行的更深入的测序揭示了古代欧洲人和亚洲人的复杂分离，并暗示了东亚地区人类的多样化遗传景观。

他们的研究还表明，他来自一个与今天的东亚人有关的人群，但不是这些人群的直接祖先，这进一步表明从4万年前到现在，亚洲有多个基因不同的人群。田园人告诉我们，从4万年前到现在，关于亚洲过去的人群还有许多未解之谜，而古代DNA将是解决这些问题的关键。

中国科学院总部

图片来源：Nogas1974

附加一篇国内相关报道：

首个针对中国地区古人类全基因组研究成果发布

　　　　（化石网报道）据新华社：首个针对中国地区古人类的全基因组研究成果12日在《当代生物学》杂志上发表，题目为“四万年前亚洲人为欧亚早期人群结构提供新洞见”。这项研究分析了距今四万年前出土于北京房山田园洞的一具男性个体的基因组，发现东亚早期人群组成十分复杂。　

　　该项目由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所与德国马普进化人类研究所等团队合作完成。这项研究获取了第一个中国地区古人类的全基因组数据，也是整个东亚目前最为古老的人类基因组数据。　　

据专家介绍，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室通过最新古DNA技术，将仅有0.03%的古人类全基因组数据从富含细菌和真菌DNA污染的古人类DNA样品中捕获出来并测序。通过比较田园洞人和未混入古老遗传成分的欧洲人的基因组数据，确定了4万年前的田园洞人确已呈现亚洲人遗传特征。虽然田园洞人是古东亚人，但他并不是现代东亚人的直接祖先，暗示了四万年前亚洲人群的多样性。

　　此外，论文还披露了一些出乎意料的发现。分析显示，四万年前的田园洞人和一个来自比利时35000年前的古欧洲人有着遗传上的联系。这种联系在同时期的其他古欧洲人中并没有被发现。因此，很有可能当时的东亚人并非和欧洲人发生基因交流，而是与同田园洞人和比利时古人相关的一个未知人群发生过基因交流；这个未知人群从尚未分化的古欧亚人群中的某一亚群演化而来。这两个古人个体之间的遗传联系，为欧洲人和亚洲人具有复杂的遗传历史提供了有力的直接证据。

　 付巧妹说，通过比较田园洞人和未混入古老遗传成分欧洲人的基因组数据，确定距今4万年前的田园洞人已呈现亚洲人遗传特征，即与欧洲人“分道扬镳”。不过，田园洞人是古东亚人，却并非现代东亚人的直接祖先。相信田园洞人最终未能繁衍至今。

之所以说田园洞人不是现代东亚的祖先，是因为田园洞人的很多基因成分都是大多数现代东亚人所没有的。

田园洞人常染色体基因中虽然有一定的东亚成分，但也有较多的南亚土著维达成分、还有部分欧洲土著猎人成分和其他高加索成分等等，这些都是大多数东亚人所没有的，在某种程度上说，田园洞人是一种混血类型的种群。田园洞人属于在冰期灭绝的古亚洲人群体，他们和今天的黄种人关系密切，和我们一样同属现代智人，长相和我们几乎也完全相同，但不是今天亚洲人的直系祖先。

　　据了解，该项研究获国家基金委和中国科学院重点研究项目、先导项目基金的资助。