原文转自:一起实验网
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前言
细胞焦亡(pyroptosis)又称细胞炎性坏死。是由炎性小体引发的一种细胞程序性死亡,表现为细胞不断胀大直至细胞膜破裂,导致细胞内容物释放进而引起强烈的炎症反应。
近年来,以细胞焦亡为研究对象的高分文章不断涌现,而且近几年国家自然科学基金的资助项目中,细胞焦亡相关项目的比例呈指数增长。说明细胞焦亡已成为当前生命科学/基础医学研究的一大热点。
早期“焦亡”一直被误以为是“凋亡”,在2001年前,提及Caspase引起细胞死亡,研究人员只有“凋亡”一种答案。那么出道22年、火爆程度与日俱增的“细胞焦亡”,分析目的和临床研究意义是什么呢?今天小编就带大家一探究竟,对于该思路有兴趣的老师可以找小编咨询,有其他感兴趣的方向也可以联系我~
研究路线
分析目的
筛选细胞焦亡相关差异基因,富集相关生物学功能和通路(火山图、热图、韦恩图、气泡图,4-6个图);
构建风险模型,筛选预后相关marker基因并计算风险得分(森林图、拟合曲线图、C-index,3-4个图);
构建预后模型,评估风险得分作为独立预后因素价值(ROC曲线、KM曲线、列线图,5-6个图);
临床分期、免疫治疗疗效等指标评估及预测(箱线图、小提琴图、KM曲线、6-10个图);
免疫浸润细胞相关性分析(TIICs)(箱线图、热图、2-4个图)。
临床意义
构建预后风险模型,用于临床提前筛选高低风险病例并提供个性化治疗;
鉴定预后相关signature基因,为疾病的早期筛选和治疗提供新参考;
预测免疫治疗疗效,为后期合理用药提供参考;
为临床治疗提供一个新的指标,可作为独立预后因素应用于临床实践。
推荐范围
肿瘤内科
结果示例
编者总结
针对细胞焦亡特征、发生机制以及其与疾病间关系的研究,可以为相关疾病的预防和治疗提供新的思路和靶点。目前已有部分团队率先在针对NLRP3炎症小体及其相关途径的疗法方面取得了一些进展,但更多的靶点和思路还有待探寻,对于该思路有兴趣的老师可以与我探讨~
原文转自:一起实验网
页面更新:2024-04-19
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